本发明涉及一种可编程癌细胞模型，其可以进行定制以模拟基因突变，例如从特定癌症患者的组织样本识别的突变的影响。模拟可以用于评估导致患者稳定缓解的候选治疗的可能性。模型利用采用矩阵的模糊认知图(FCM)模拟器来表示健康细胞信号传导关系和表示一种或多种基因突变的输入疾病向量。疾病状态向量乘以矩阵多次迭代之后得到稳定的病变细胞状态向量。然后可以基于病变细胞状态向量提议候选治疗。在利用治疗向量进行多次迭代之后，可以对所提议的治疗对患者特定的癌症的疗效进行评估，由此减少对传统试验和错误做法的依赖。