本发明公开了一种用于养殖水体改良的微生物制剂。所述的微生物制剂其特征在于，原料包括枯草芽孢杆菌20-40％；解淀粉芽孢杆菌20-40％；布拉迪酵母20-50％及沼泽红假单胞菌5-10％。制备方法为：分别将枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌、沼泽红假单胞菌、布拉迪酵母接种于相应的培养基中，得到种子培养液；将各种子培养液按比例依次接种到培养基中发酵，再经过高速离心，得到高浓度的菌液；将菌液移入基质中混合，最后制粒、干燥、粉碎。使用本发明后，养殖水质变清，换水量明显减少，节约了水资源，减少对外排放产生的污染。水质环境的改善，降低了水产养殖产品的用药，减少了抗生素的污染，符合食品安全要求，保证了产品质量。