一种用于评估穿心莲抗菌活性的方法，所述方法以穿心莲抑菌率I%来评估穿心莲抗菌活性，所述I%根据以下的公式（1）来计算：I%=（t₂–t₀）/t₀×100%（1），其中，t₀为在未经药物干预的细菌生长代谢热谱曲线中的第二指数生长期的达峰时间，t₂为在经穿心莲干预的细菌生长代谢热谱曲线中的第二指数生长期的达峰时间，其中干预细菌生长代谢的穿心莲供试品溶液的浓度在0.4～4mg/mL之间，优选地为3mg/mL。本申请的方法能够定性地分析不同产地、不同制备方法、不同生产批次或不同的生长时间等的穿心莲的抗菌活性。