本发明公开了一种白药子总生物碱提取物及其制备方法，包括以下步骤：将白药子干品粉碎，加热提取，滤液减压浓缩；加热水稀释，酸化，过滤得滤液；碱化，过滤得滤液，将所得滤液经陶瓷膜过滤器进行分子截留滤过；正丁醇萃取，减压浓缩；浓缩液喷雾干燥得干粉提取物；加乙醇超声提取，合并提取液，提取液通过葡聚糖凝胶柱，用90～95%的乙醇洗脱，分段收集，经高效薄层色谱法鉴别，合并含有生物碱部位，低温冷冻，析出生物碱晶体粗品；加乙醇溶解，静置，冷冻，得到白药子总生物碱纯品。本发明的白药子总生物碱药物制剂，对于白细胞减少症，尤其是肿瘤病人放、化疗引起的白细胞减少症，以及其他药物所致的白细胞减少症都有辅助治疗的作用。