本发明涉及一种应用于食品、保健品的天然薄膜包衣剂，其组份及其重量份数比为：纤维素醚衍生物40～67重量份；海藻多糖3～32重量份；天然色素1～10重量份；小分子糖醇2～25重量份；卵磷脂4～15重量份。本发明包衣剂采用天然植物原料，重金属铅和砷的污染很小，不会直接影响到包衣剂，实际测定重金属砷、铅的含量也符合食品添加剂法规标准；不含化学合成原料，其中不会存在有害化合物及单体残留，完全保证了食品保健品对于安全性的要求。天然包衣剂中主要成分均可在水中溶解，这样在包衣过程中可以不必采用有机溶剂，大大节约了生产成本。而且用水溶液包衣，也使包衣后的药物不存在有机溶剂残留的问题，提高了药物的安全性。