本发明属于药物制剂领域，具体是涉及一种长循环伊立替康脂质体组合物包括伊立替康、氢化大豆磷脂酰胆碱或二硬酯酰磷脂酰胆碱、胆固醇、培化磷脂酰乙醇胺、金属螯合剂，其用重量组成分别为伊立替康1份，氢化大豆磷脂酰胆碱或二硬脂酰磷脂酰胆碱2~4份，胆固醇0.5～1.5份，培化磷脂酰乙醇胺0.4～1.2份，金属螯合剂0.0104～0.051份。本发明还公开了所述脂质体组合物的制备方法，及其制备伊立替康脂质体组合物注射剂的应用。本发明提供的伊立替康脂质体组合物及其制备方法，大大提高了伊立替康的载药率，包封率大于99.5%，可明显减少未包裹药物的毒副作用；有关物质低于0.5%，各毒性杂质限度低于0.1%，明显提高了该制剂的安全性，并且产品粒度分布均匀，稳定性良好。