一种肿瘤坏死因子-α转化酶的多肽抑制剂的筛选方法及其应用，属于生物医学领域。所述方法先建立合理的TACE与多肽底物的复合物模型，用以指导多肽抑制剂的设计，然后通过检测一系列指标，如结合能力、抑制能力等，筛选出可作为多肽抑制剂的候选多肽；所选出的多肽特异性高，活性强，可进一步用于设计以肿瘤坏死因子-α转化酶为靶标的多肽药物。