本发明公开了一种中空亚微米球及其制备方法和应用。所述中空亚微米球的壳层是有机无机复合结构，热力学稳定性好，结构稳定性高，同时，其具有内部疏水而外部亲水特性，可应用于油水分离、疏水药物输送、催化剂保护、纳米反应器等领域，是一种具有广阔应用前景的材料。且本发明采用的制备方法工艺简单，重复性好，模板除去条件温和，采用水为分散介质，环境污染少。