本发明公开了一种含肟菌酯与环唑醇的杀菌组合物及其应用，该组合物将肟菌酯和环唑醇进行复配，具有很好的协同增效作用，其中肟菌酯与环唑醇的重量比为1∶1至10∶1。本发明组合物扩大了杀菌谱，提高杀菌效率，避免了病害的抗药性，延长了药物持效期，在防治蔬菜、果树中的白粉病、黑星病、斑点落叶病等病害中有很好的效果。