本发明公开了一种治疗小儿轮状病毒肠炎的中药组合物，所述中药组合物中内服药物中原料药为：山柰，白头翁，石榴皮，丁香，白术，茯苓，大腹皮，黄柏，陈皮，沙参，小茴香，马齿苋，马蹄香，当归，党参，焦三仙，鸡内金，大青叶，白花蛇舌草，连翘、云木香。外用药物为：小茴香，肉桂，骨碎补，大青叶，细辛，黄芩，蒲公英，荆芥，白芷，黄连，马齿苋。对婴幼儿久泻不愈，或伴有呕吐、吃药困难等情况，迅速控制症状的特点，且药剂易于制造，成本低廉，制作工艺简便，毒副作用小且给药方便。本发明为中药制剂，但精选气味平和的中药，使中药制剂的气味并不浓烈，适合儿童口感，让儿童不至于产生厌烦情绪。内服外用共同作用，疗效更加显著。