本发明涉及一种可缓释抗菌肽的糖胺聚糖基水凝胶及其制备方法。本发明主要通过使用糖胺聚糖分子原位聚合包埋人源抗菌肽分子制备出一种具有较好的生物相容性和药物安全性的医用水凝胶敷料。通过控制被包埋人源抗菌肽分子浓度和糖胺聚糖的酰肼化衍生物和醛基化衍生物的数量，形成水凝胶抗菌肽药物缓释系统。本发明具有绿色环保、操作简便、工艺简单的特点。制备得到的糖胺聚糖基水凝胶可缓释载体材料，具有控制释放抗菌肽行为的能力。