本发明公开了一种酚咖肠溶胶囊及其制备方法，本发明的酚咖肠溶胶囊由酚咖肠溶微丸装入胶囊壳中制得，所述酚咖肠溶微丸由酚咖微丸和包裹在外的肠溶包衣层组成，所述酚咖微丸包括对乙酰氨基酚、咖啡因和填充剂，所述肠溶包衣层包括肠溶材料、增塑剂和抗粘剂，制备时在酚咖微丸外裹上肠溶包衣层即得。本发明药物服用方便，可减少药物对胃黏膜的刺激，肠溶效果理想，可提高生物利用度，且制备工艺简单，所得产品质量稳定，适合大规模生产应用。