本发明涉及一种海洋贝类养殖氮、磷及有机碳排泄量的估算方法，包括步骤有：⑴试验样本获取及样本处理；⑵分组测定每组样本的总氮Y_N、总磷Y_P、总有机碳Y_C的排泄总量；⑶计算第i组实验贝类的平均长度L_i及平均排泄量为Y_i；⑷建立回归模型；⑸利用建立的回归模型对整批养殖群进行预测。本发明方法比较准确的计算出养殖区内贝类的氮、磷和有机碳排泄量，为生态监测提供有效的数据，为贝类的规模养殖管理提供了科学依据，为合理利用海洋资源，控制海洋污染，有持续性的进行海洋贝类生产提供了保证。