本发明公开了一种具有荧光的抗菌铜三元配合物及其制备方法和应用，其化学组成为Cu(HqnH)(Phen)Cl₂(H₂O)·2H₂O，Cu为铜，HqnH为喹啉-2-甲酸，Phen为1，10-菲啰啉。本发明的一种具有荧光的抗菌铜三元配合物具有强荧光性能和强抑菌活性，具有良好的脂溶性和化学稳定性，可利用其自身具有的荧光标记识别性能研究该类抗菌药物与DNA作用机理以及观察其在体内的分布并追踪其摄入、排出的动力学过程，可作为抗菌药物应用于生物医药领域。