本发明公开了具有双向免疫调节作用的马甲子提取物及其作为制备治疗免疫功能异常疾病药物的用途。所述中药提取物为马甲子叶、马甲子根、马甲子茎叶或马甲子全株植物的甲醇、乙醇、乙酸乙酯、石油醚或类似溶媒提取物，主要含有萜类、黄酮类、生物碱类、香豆素类（包括上述物质的苷类和单体）、多糖类、纤维素等，其制剂包括片剂、胶囊剂、贴膏剂、颗粒剂、注射剂、栓剂、软膏剂、凝胶剂、涂膜剂、搽剂、洗剂和喷雾剂。马甲子提取物及其制剂具有双向免疫调节作用，可作为制备治疗免疫功能低下或自身免疫性疾病药物的应用。