本发明公开一种海水养殖扇贝笼和贝壳上污损生物的生物清除方法，在扇贝笼内混养海胆，构建成“扇贝—海胆”综合养殖系统；每养殖栉孔扇贝、海湾扇贝或华贵栉孔扇贝30个混养1-2只马粪海胆；每养殖虾夷扇贝10个，混养1-2只马粪海胆。本发明的有益效果是：（1）、降低清理附着生物所增加的养殖成本；（2）、提高扇贝的生长速度,改善品质；（3）、提供了一种低成本的海胆养殖方法；（4）、提高了海胆养殖的成活率和养殖经济效益。