本发明提供一组活性化合物在制备抑制DJ-1二聚化的药物中的应用。通过基于DJ-1蛋白晶体结构的计算机辅助虚拟方法和技术、药物化学知识、和药理活性筛选发现一组抑制DJ-1二聚化的化合物，共23个。根据结构相似性系数Tanimoto值大于0.85的化合物，具有相似的生物活性原理，确定与这组化合物分子结构相似性Tanimoto值大于0.85，也具有相似的抑制DJ-1活性。本发明以与肿瘤发生发展相关的DJ-1蛋白为研究对象，筛选得到具有抑制DJ-1蛋白二聚化和抑制肿瘤细胞增殖的化合物。这些化合物不但能够抑制DJ-1蛋白的二聚化，而且对肿瘤细胞有较强的抑制活性，具有良好的药物开发前景。