本发明公开了一种利用高含盐氨基酸废水发酵生产饲料用枯草芽孢杆菌的方法。步骤为：1. 饲料菌株的驯化培养：通过连续驯化培养的手段，提高菌株对高含盐氨基酸废水的耐受力； 2. 菌株的发酵，在合适的发酵条件下，于发酵罐中通过一定时间的液体通气培养后得到饲料用枯草芽孢杆菌菌体。离心收集菌体后于70℃烘箱内干燥至恒重后称重。经计算每升高含盐氨基酸废水最高可获得35 g饲用枯草芽孢杆菌菌体。利用本方法，可有效利用废水中含有的氨基酸、微量元素和生长因子，大大降低饲用枯草芽孢杆菌的发酵成本，同时还大为减小了污水处理负荷，达到了综合利用的效果，具有显著的经济与社会效益。