本发明公开了一种环保型复合微生物制剂及其制备方法，属于环境生物技术领域，本发明的复合微生物制剂，包括如下组分：(1)占总重量10％的复合微生物菌剂，所述复合微生物菌剂由掷孢酵母、球形芽孢杆菌、植物乳杆菌和类球红细菌组成；(2)占总重量90％的微生物载体，组成为麸皮或米糠20-50份；有机膨润土160-300份；水40-80份。本发明复合细菌和真菌，扩大了适用范围，不仅可用于城市固体生活垃圾、生产污水等的除臭处理，而且可用于被重金属铬污染的废水的降解。