本发明公开了一种基于MBBR的厌氧氨氧化好氧限氧启动方法，属于污水处理领域。通过采用MBBR工艺进行厌氧氨氧化工艺的启动，旨在解决以往活性污泥法启动厌氧氨氧化过程中污泥容易随产生的气体上浮流失，生物膜法启动厌氧氨氧化过程中微生物不易挂膜难以富集、长时间运行容易堵塞等问题，且以往方法启动速度慢，工程化应用较难。本发明技术方案包括硝化启动、好氧启动、厌氧氨氧化运行，仅接种普通活性污泥，经历120-150d即出现明显的厌氧氨氧化效果，最终总氮膜面负荷达到7.9gN/m²/d以上。本发明工艺启动速度快、生物膜活性高、运行可靠，总氮去除高效、稳定、低碳。