本发明公开了一种河流分流净化美化治理系统及方法，其中壅水系统包括在河床底部设置的液压翻板闸门及与液压翻板闸门配合使用的挡水胸墙，液压翻板闸门和挡水胸墙之间形成泄流通道，液压翻板闸门随着河水流量的变化，自动调节泄流通道的开度以控制下泄流量，保持壅水系统水位稳定；分流系统设置在壅水系统的下段，在河道的岸墙顶部设置钢筋混凝土的盖板，盖板盖住整个河道，壅水系统上层河水经盖板上面流动，下层的河水分流至盖板下面的河道流动。盖板下面的河道靠近两岸岸墙的下部筑有污水槽，能将两岸流向河道的城市污水导向下游流入污水处理系统。本发明是一种能够节约土地、美化视野、降低造价、方便管理的河流分流净化美化治理系统及方法。