本发明公开了一种反硝化细菌及其应用，该反硝化细菌命名为嗜麦芽寡养单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)CM-NRD3，已于2012年11月12日保藏在位于中国武汉武汉大学的中国典型培养物保藏中心(简称CCTCC)，保藏编号为CCTCC NO：M 2012455。本发明还提供了嗜麦芽寡养单胞菌CCTCC M 2012455在污水或水体中生物脱氮的应用。本发明菌株对硝酸盐氮和亚硝酸盐氮均具有很强脱氮能力，还能去除污水或水体中的CODcr，适合多种氮素污染型的水质，也可以用于短程硝化反硝化工艺，能应用于低C/N水体的生物脱氮处理，有利于其推广应用。