一种化学阴极微生物燃料电池浸出钴酸锂中Co(III)的方法，在微生物燃料电池的阳极室，装有电化学活性微生物以及阳极液；在微生物燃料电池的阴极室，装有阴极液和钴酸锂颗粒；阳极室接种污水处理厂的澄清池污泥作为电化学活性微生物；阴极液为无机酸溶液；阴极和阳极电极均为石墨材料。本发明过程清洁高效、副产电能、方法简单、成本低，对于处理废旧锂离子电池并浸出其中的钴金属具有很好的应用前景。