本发明涉及一种提高微生物燃料电池驱动微生物电解池回收多金属的方法，属于重金属回收处理领域。分别以Cr(VI)和Cu(II)为阴极电子受体的MFCs_Cr和MFC_Cu串联后的阳极与以Cd(II)为阴极电子受体的MECs_Cd阴极相连，MFCs_Cr和MFC_Cu串联后的阴极与MECs_Cd阳极通过串联电阻相连；MFCs_Cr和MFC_Cu的阴极为碳棒，MECs_Cd的阴极为不锈钢网或钛片；MFCs_Cr、MFC_Cu和MECs_Cd的阳极为碳毡或碳棒。本发明可处理电镀废水、印刷电路板蚀刻废水和市政等有机污水并回收铬、铜和镉金属，而且为原位利用MFCs的输出电能、拓展生物电化学系统的应用领域和使用范围提供了广阔空间。