本发明涉及由蓝藻水华制备生物净水剂用于处理含重金属污水的方法。打捞的蓝藻水华，经过高温灭菌处理，接种蜡状芽孢杆菌BacilluscereusCGMCC1.0126，培养3天，制备成生物净水剂。处理重金属废水时，根据重金属含量，将以一定比例加入生物净水剂，并调节混合物pH为5~6，吸附30min。此方法的生物净化率（除去的金属量/初始金属量）较高，Cd、Ni、Cu的去除率分别可达到90%、80%、75%。本发明以污染废弃物蓝藻水华为原料，制备的新型的生物净水剂，具有低成本、无二次污染、适用范围广等特点。消除了污染，节约了资源，达到“以污治污，转废为用”的目的。