本发明涉及一种富营养化水体的生态修复方法，其特征在于包括如下步骤：a.将污水处理厂二沉池的活性污泥置于培养池中培养获得厌氧微生物群；b.培养水生植物，并将培养后的部分水生植物置于培养的厌氧微生物群中进行再次培养，使水生植物上形成一层微生物膜；c.河道预处理，除去水面上的大颗粒漂浮物；d.将步骤b中培养好的水生植物置于经过预处理的河道水域中。本发明在净化水质的同时美化了水体，还能提高水体的自净能力，修复速度较快，不产生二次污染，成本少，能保持生态系统长期稳定。