适用于水源热泵空调机组的污水过滤系统及过滤方法，属于水源热泵空调机组的水源处理技术领域。本发明为了解决直接采用城市污水及地表水作为水源热泵空调机组的水源，会造成空调机组的堵塞，并进而导致设备无法正常运行的问题。装置包括热泵空调机组、污水泵、第一液体流动方向控制器、第一电动先导换向执行器、第一污水过滤器、第二污水过滤器、第一单向阀组、第二单向阀组、第一压差传感器、第二压差传感器和PLC控制器；方法为PLC控制器根据两个压差传感器时时采集的压差信号，对电动先导换向执行器进行相应的控制，使液体沿着相应的液体流动方向控制器的进出口流动，进而实现水流方向的控制。本发明用于热泵空调机组的污水过滤。