本发明公开了一种基于MBBR的高盐度废水氨氮的去除方法，属于污水处理领域。针对高盐度水的氨氮，通过采用MBBR工艺进行处理，旨在解决以往生化工艺难以启动、去除效果差及处理效果不稳定、系统耐盐度冲击性能差等问题。本发明技术方案包括接种启动、高盐度启动、高盐度连续流运行，最终氨氮膜面负荷大于0.85gN/m²/d，出水氨氮稳定≤5mg/L，满足城市污水厂污染物排放标准对氨氮的要求。本发明工艺占地面积小、操作简单、运行可靠、无固定床工艺滋生红虫、布水不均匀易形成死区等问题，相比生物流化床其氧利用率高、曝气流化能耗低。