本发明公开了一种用于处理城市河道、湖泊中生活污水的生态净化处理系统，通过对各处理池的连接设计以及合理改进，提高了净化处理效果。本发明包括依次连通的布水缓流池、错流生物接触曝气池、压泥池、生物膜深度净化池，以及与设置在各处理池底部低处的排泥口连接的集泥井；还包括分离池、厌氧发酵池、集水池，污水依次经过分离池、厌氧发酵池、集水池后进入布水缓流池中。本发明对垃圾、油、水、泥分别进行分离，对污水引流并经过多级净化分解处理，通过各处理池中的细节设计，消除死角、提高净化效率。此外，利用本系统本身被处理污水作为培养液，对分解菌分为厌氧菌和好氧菌分别进行循环利用和培养，最终获得有益菌作为优势菌群，替代有害菌。