本发明提供了一种反硝化厌氧氨氧化处理高浓度硝酸盐废水与城市污水的方法，属于污水生物处理领域。所述方法包括先分别培养和驯化具有不完全反硝化特性的反硝化菌群和厌氧氨氧化菌，再接种厌氧氨氧化污泥与具有较高亚硝酸盐积累率的反硝化污泥于同一反应器中，硝酸盐废水与城市污水按一定比例进入反硝化厌氧氨氧化SBR反应器，硝酸盐还原过程积累的亚硝酸盐与城市污水中的氨氮再通过厌氧氨氧化生成氮气而同步得到去除。该方法无需外加碳源条件下，反硝化菌可将厌氧氨氧化过程产生的硝酸盐还原，提高系统脱氮效率，提供了实现高效、低能耗污水脱氮的有效途径。