本发明公开了一种旁路亚硝化-厌氧氨氧化滤池处理城镇污水的方法。城镇污水首先进入厌氧除磷池，通过除磷菌分解细胞内的聚磷酸盐同时产生ATP；厌氧除磷池出水进入好氧池，通过活性污泥分解污水中的有机物质，摄取污水中的磷，并氨化有机氮；好氧池出水进入沉淀池，进行固液分离；沉淀池出水的51%直接进入厌氧氨氧化滤池；沉淀池出水的另外49%通过旁路进入亚硝化滤池，将污水中的氨氮氧化成亚硝酸盐，然后进入厌氧氨氧化滤池；在厌氧氨氧化滤池中，将污水中氨氮和亚硝酸盐转化为氮气。本发明与常规的城镇污水处理方法相比，各处理单元的反应专性更强，停留时间更短，去除率更高，有机碳源消耗量更低，更节能，反应条件更易控制，稳定性更好。