本发明公开了一种负载纳米载药胶囊的海藻纤维的制备方法。以海藻酸钠为基质制备纳米载药胶囊；并将其添加至海藻酸钠纺丝液中；通过湿法纺丝制备负载载药纳米胶囊的海藻纤维。本发明可以减少纺丝过程中药物的流失，胶囊包覆药物，能够有效防止药物变性，并可负载不同种类的药物。此外，胶囊以海藻酸钠为基质制备，与同质纤维界面相容性好，且载药胶囊呈纳米级别，不会影响海藻酸纺丝液的可纺性及最终纤维性能。本发明可应用于敷料、纱布、绷带、药贴、药垫等医用材料，达到降低伤口感染、发炎，刺激细胞增殖，从而加速创面愈合等作用，还适用于肿瘤手术后的局部化疗。