本发明提供射频识别保密系统及方法。此射频识别保密系统包含一射频识别标签以及一便携式电子装置。此射频识别标签具有一使用者识别码。此便携式电子装置包含一读取器、一识别存储单元以及一识别控制器。读取器用以与射频识别标签建立通讯，并接收使用者识别码。识别存储单元用以储存使用者密码。识别控制器则电性连接读取器以及识别存储单元，并比较使用者识别码以及使用者密码。当使用者识别码与使用者密码时，识别控制器发出开启信号以开启便携式电子装置的使用权限。