本发明涉及药物制剂领域，具体涉及一种肝素修饰的阿霉素脂质体(Hep-DOX-Lip)制剂，其特征是由阿霉素1份、肝素1～4份、大豆卵磷脂5～30份、胆固醇0.5～4份、阳离子材料0.5份，本发明还公开了这种肝素修饰的阿霉素脂质体的制备方法。本发明用肝素修饰阿霉素脂质体，具有类似PEG化的效果，可显著提高阿霉素脂质体的稳定性，延长药物的体内半衰期，提高药物的生物利用度，同时可显著降低化疗药物的毒副作用，提高患者的顺应性。