本发明公开了一种SWIFT报文处理系统，包括：中央系统，包括中央服务器、SWIFT ALLIANCE终端以及通讯模块；至少一个子系统，包括子服务器、至少一个客户端以及交互模块，本发明通过建立子系统和中央系统，改变了现有技术中在每个分行分别设置终端的方式，有效降低了成本；并且，本发明通过直连所述子系统和中央系统，实现了报文的实时收发以及报文数据的集中处理，从而有效提高了银行业务的处理效率。