本发明涉及一种基于逻辑子光纤的保护方法，尤其涉及光通讯领域同步数字体系(SDH)的自动保护倒换(APS)。本发明按照规划和需求制定划分逻辑子光纤原则；根据上述原则决定是否需要复用K1K2开销字节；从K1K2开销字节搜集APS信令到对应的APS协议处理组中：APS协议信令信息输出到对应被复用或不复用K1K2开销字节中。本发明只需要增加较小的开销，就使得基于复用段的APS具有通道保护的高度灵活性，拓展了复用段自动保护倒换的应用范围，从而可以降低综合成本。