本发明公开了一种边界扫描测试的控制器及测试方法，所述控制器包括，PC机单元、USB接口单元、双端口存储单元、控制及转换单元；所述PC机单元，完成测试的设置、测试矢量的生成、测试数据的发送接收、测试数据的分析、测试结果的存储以及控制器的USB驱动；所述USB接口单元，实现边界扫描测试控制器与计算机的通讯；所述双端口存储单元，实现测试向量的存储，测试响应的存储；所述控制及转换单元，产生边界扫描测试时钟，实现将测试数据转换成JTAG信号，且实现从双端口存储单元中数据的读写。本发明采用USB接口，双端口的存储器及FPGA设计，即插即用，实现了数据传输与边界扫描测试同时进行，提高了测试速度。