本发明涉及一种纯电动汽车空调控制系统及其控制方法，采用如下步骤：空调压缩机控制器CLM与整车控制器VMS之间通过CAN网络进行通讯；空调压缩机控制器CLM根据当前外界温度判断空调压缩机的工作状态；空调压缩机控制器CLM向整车控制器VMS发送打开空调压缩机的请求；整车控制器VMS判断当前整车的状态；整车控制器VMS确定打开空调压缩机AC请求是否有效；整车控制器VMS反馈信号至空调压缩机控制器CLM；空调压缩机控制器CLM根据整车控制器VMS反馈信号打开或关闭空调压缩机。