本发明公开了一种基于软件数字证书的移动终端唯一性认证方法，属于计算机和信息安全技术领域，具体如下：(1)移动终端安装安全客户端，生成与设备信息关联的证书请求向服务端注册。服务端给移动终端发放数字证书，实现数字证书与设备的关联。(2)使用时，服务端向移动终端发送随机信息，安全客户端收到信息，使用本机的数字证书私钥对随机信息签名，将签名数据发送到服务端。应用服务器使用数字证书公钥验证签名，确认通讯对端身份。本发明能够很好对移动终端进行验证，在不增加硬件认证设备基础上增强了认证的强度。