本发明是水下地形测量系统及制作方法和测量方法。由至少1艘测量船、基准站、主操控设备和遥控设备组成，基准站、主操控设备和遥控设备在岸上实施操控，基准站、主操控设备和遥控设备同时操控多艘测量船，测量船由船体、控制系统、航行航向控制系统、定位系统、测量系统和通讯系统组成，测量船的船体整体由船首和船身各自独立分段构成，设备安装柱的下端部固定设置测深仪探头，船身的承载舱内固定安装数据通讯电台、GPS电台、测深仪、GPS设备、蓄电池组、电源模块和工业控制计算机，发动机上安装启动机，启动机由点火装置、熄火开关和启动熄火检测电路构成，本发明设计科学，结构合理，操作简便，方便灵活，安装拆卸方便，便于运输转场，适应各种不同水域的水下测量，实现水下测量自动化。