本发明提供了一种机床控制器，包括管理单元、通讯模块及控制单元。管理单元经通讯模块发送指令给控制单元，控制单元包括译码模块、判断模块及插补模块，译码模块将指令进行译码，插补模块包括粗插补模块及与粗插补模块连接的精插补模块。其中，判断模块判断指令，当指令为进给指令，调用粗插补模块，粗插补模块根据进给指令计算出脉冲频率及脉冲数。精插补模块包括至少一个脉冲信号发生器，控制单元还包括基准模块，基准模块输出基准源给脉冲信号发生器。脉冲信号发生器根据粗插补模块的计算出的脉冲频率及脉冲数控制基准源的输出，从而发出均匀的脉冲信号。本发明的机床控制器能够快速地输出均匀的脉冲，从而能够驱动机床平稳高速地运行。