本发明公开了一种电动车高压双回路安全保护系统及其方法，所述电动车高压双回路安全保护系统包括由VMS整车控制器，电机控制器总成，驱动电机和高压动力电池包总成通过硬线串联连接构成的硬线控制回路，以及并联在整车CAN网络上的VMS整车控制器，电机控制器总成中的MCU控制板和高压动力电池包总成中的BMS电池管理系统构成的通讯网络控制回路，本发明所述的控制方法主要是通过各个控制系统的自检和CAN通讯网络进行安全信息交互校验来决定动力电池是否对外输出高压电。本发明所述的双回路高压安全保护系统能够可靠的实现保护电动车或混合动力车内的高压电气设备、高压输电线路以及操作人员安全的目的，大大提高了整车的高压电安全性和可靠性。