本发明公开了一种无人飞行器的智能追踪控制方法，包括以下步骤：悬停获取无人飞行器的位置和目标的视频信号；通过无线通讯将无人飞行器的位置和目标的视频信号传输到地面的视频分析模块；对视频信号进行分析得到目标的位置和大小；根据目标的位置，计算得到无人飞行器的位置调整数据；根据无人飞行器的位置调整数据，调整无人飞行器的位置。本发明还公开了一种无人飞行器的智能追踪控制系统，包括：摄像机、GPS、无线通讯模块、视频分析模块、控制模块、执行模块。本发明的无人飞行器的智能追踪控制方法及系统，使无人飞行器能自动完成追踪目标的任务，提高了无人飞行器跟踪目标的精度，实现了对目标的高精度跟踪。