本发明涉及一种LED控制器无线分区系统，包括通过无线网络依次导通连接的一个用于与主控制器进行通讯以改变其控制模式，或者通过主控制器与从控制器进行通讯以改变其控制模式的设置有唯一的识别码的遥控器；一个用于根据遥控器发送过来的无线控制信号对与其匹配连接的LED灯具进行控制，或者将无线控制信号转发送至从控制器的主控制器；和至少一个用于根据主控制器转发送过来的无线控制信号对与其匹配连接的LED灯具进行控制的从控制器；而且主控制器和每一从控制器均设置有唯一的分区标识和学习识别码，与相应分区的LED灯具匹配连接，实现LED灯具的无线分区控制。实现一个遥控器分时操作多个控制器，无干扰、成本低、操作简单方便。