本发明涉及一种脉冲激光器及其打标系统，该脉冲激光器包括激光生成模块，以及：与图形编辑装置通讯的图形接口模块；与振镜装置通讯的振镜接口模块；以及控制模块，用于通过从图形编辑装置接收图形编辑数据，并对所述图形编辑数据进行分析，根据分析结果生成激光控制信号和振镜控制信号，其中激光控制信号发送给激光生成模块控制其生成激光信号，振镜控制信号通过发送给振镜装置执行振镜动作。本发明通过在脉冲激光器中集成激光打标控制的功能，使其与脉冲激光器的控制功能在同一运算单元内实现，进而将控制信号的传输时间由毫秒级别缩短到微秒级别，同时降低了成本；此外各部件之间的走线极大缩短，加强了系统的稳定性，可靠性及抗干扰能力。