本发明公开了一种质子泵抑制剂肠溶微丸，包括空白丸心、载药层、隔离层和肠溶层，其特征在于，其中含有至少一种碱性化合物，其中碱性化合物不超过微丸总重的5%，所述碱性化合物的粒径D90不高于75um，本发明的肠溶微丸制剂不仅可以降低碱性化合物对药物的吸附作用，提高药物的体外释放度，还可以提高质子泵抑制剂周围环境的碱性，增强药物的稳定性。