本发明涉及一种全新的软件运行方法和软件运行系统。软件运行系统，包括客户端执行模块和服务器端控制与数据分发模块；客户端执行模块进包括；进程加载子模块，其获取和加载软件包定义文件，并在客户端建立起应用程序运行所需的环境；为待执行的应用程序创建所对应的进程；I/O监控及处理子模块，监控并截获应用程序的I/O请求；网络通讯子模块，与服务器端进行网络通讯；服务器端控制与数据分发模块包括：控制子模块，协调客户端和服务器端其它子模块之间的工作；数据分发子模块，为客户端提供软件包中的具体数据。本发明软件运行系统大大减少了对客户端计算机存储空间的要求，也免除了在客户端进行整个软件安装的过程。