本发明公开一种锂离子电池组均衡系统及其均衡方法，该均衡系统包括电池组及升降压斩波电路，还包括总线通讯模块，隔离电路，单体电压采样模块，单片机以及开关驱动电路，总线通讯模块与隔离电路相连接用于与其它模块之间通讯；单片机与隔离电路相连接并根据单体电压采样模块获取电池组中每个单体电池的电压，并计算出每个单体电池的荷电状态，然后通过开关驱动电路控制升降压斩波电路中的各个开关；升降压斩波电路能够使其电路内的任意相邻的两个单体电池之间进行充、放电。本发明的均衡系统结构简单，成本低且可靠性好。