本发明涉及一种利用独立操作系统查杀电脑病毒的方法，包括独立操作系统、查杀病毒客户端、远程升级服务器，其特征在于，查杀病毒客户端以独立操作系统为运行平台，所述独立操作系统，具有不依赖硬盘原有操作系统，不会感染硬盘中可能存在的Windows病毒，独立识别、驱动电脑硬件、引导桌面环境、网络环境监测、联入Internet并运行查杀病毒客户端。查杀病毒客户端，包含查杀病毒模块、病毒特征库及第一通讯模块，远程升级服务器，包含新病毒特征库及第二通讯模块，用于与第一通讯模块通讯，传递新病毒特征库。本发明在应用上，具有独立操作系统及查杀病毒客户端不会被病毒感染破坏，可以通过网络更新病毒特征库，有效查杀新增病毒。