本发明为了克服即时通讯产品发送文件时，尤其对方不在线的状态下，无法同时输入附加信息的缺陷，提供了一种在即时通信工具中传输文件的方法及系统，包括步骤：发送者选择待发的文件，输入附加消息；发送者发送文件，客户端发送控制消息给即时通讯服务器；即时通讯服务器选择文件传输服务器，通知客户端和文件传输服务器；客户端连接文件传输服务器，发送文件数据；即时通讯服务器通知接收者接收，接收者客户端显示文件属性。从而客户端发送文件时，可以输入附加信息，描述发送的目的，或文件内容的概要；接收者收到“接收文件通知”时，会显示该附加信息，这样接收者可以明白发送者发送的目的，或者该文件的大致内容，或者能看出该文件的重要性，甚至是否需要打开等。